Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccnl1Q52KE7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccnl1Q52KE7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccnl1Q52KE7 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccnl1Q52KE7 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms