Protein–RNA interactions for Protein: Q4VBF2

R3hdm4, R3H domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3hdm4Q4VBF2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
R3hdm4Q4VBF2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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