Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc3lQ4KL14 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms