Protein–RNA interactions for Protein: Q497V5

Srbd1, S1 RNA-binding domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,015 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srbd1Q497V5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srbd1Q497V5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srbd1Q497V5 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srbd1Q497V5 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srbd1Q497V5 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srbd1Q497V5 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srbd1Q497V5 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srbd1Q497V5 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srbd1Q497V5 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srbd1Q497V5 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srbd1Q497V5 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srbd1Q497V5 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srbd1Q497V5 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Srbd1Q497V5 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srbd1Q497V5 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srbd1Q497V5 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srbd1Q497V5 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srbd1Q497V5 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Srbd1Q497V5 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Srbd1Q497V5 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srbd1Q497V5 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srbd1Q497V5 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srbd1Q497V5 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Srbd1Q497V5 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srbd1Q497V5 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srbd1Q497V5 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srbd1Q497V5 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srbd1Q497V5 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srbd1Q497V5 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srbd1Q497V5 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srbd1Q497V5 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srbd1Q497V5 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srbd1Q497V5 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srbd1Q497V5 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srbd1Q497V5 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srbd1Q497V5 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srbd1Q497V5 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srbd1Q497V5 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srbd1Q497V5 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srbd1Q497V5 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srbd1Q497V5 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srbd1Q497V5 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srbd1Q497V5 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srbd1Q497V5 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Srbd1Q497V5 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Srbd1Q497V5 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Srbd1Q497V5 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srbd1Q497V5 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srbd1Q497V5 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srbd1Q497V5 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srbd1Q497V5 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srbd1Q497V5 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srbd1Q497V5 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srbd1Q497V5 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Srbd1Q497V5 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Srbd1Q497V5 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Srbd1Q497V5 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Srbd1Q497V5 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srbd1Q497V5 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srbd1Q497V5 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srbd1Q497V5 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Srbd1Q497V5 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srbd1Q497V5 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srbd1Q497V5 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srbd1Q497V5 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srbd1Q497V5 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Srbd1Q497V5 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srbd1Q497V5 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srbd1Q497V5 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srbd1Q497V5 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srbd1Q497V5 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srbd1Q497V5 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srbd1Q497V5 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srbd1Q497V5 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srbd1Q497V5 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srbd1Q497V5 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srbd1Q497V5 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srbd1Q497V5 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srbd1Q497V5 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srbd1Q497V5 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Srbd1Q497V5 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srbd1Q497V5 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Srbd1Q497V5 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srbd1Q497V5 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Srbd1Q497V5 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srbd1Q497V5 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srbd1Q497V5 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srbd1Q497V5 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srbd1Q497V5 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srbd1Q497V5 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srbd1Q497V5 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srbd1Q497V5 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srbd1Q497V5 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srbd1Q497V5 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srbd1Q497V5 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srbd1Q497V5 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srbd1Q497V5 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srbd1Q497V5 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srbd1Q497V5 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srbd1Q497V5 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms