Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Carmil2Q3V3V9 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Carmil2Q3V3V9 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Carmil2Q3V3V9 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Carmil2Q3V3V9 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Carmil2Q3V3V9 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Carmil2Q3V3V9 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Carmil2Q3V3V9 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Carmil2Q3V3V9 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Carmil2Q3V3V9 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Carmil2Q3V3V9 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Carmil2Q3V3V9 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Carmil2Q3V3V9 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Carmil2Q3V3V9 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Carmil2Q3V3V9 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Carmil2Q3V3V9 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Carmil2Q3V3V9 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms