Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q1

Dnah12, Dynein heavy chain 12, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 3,086 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah12Q3V0Q1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dnah12Q3V0Q1 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnah12Q3V0Q1 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnah12Q3V0Q1 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnah12Q3V0Q1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnah12Q3V0Q1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnah12Q3V0Q1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Dnah12Q3V0Q1 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dnah12Q3V0Q1 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnah12Q3V0Q1 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dnah12Q3V0Q1 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnah12Q3V0Q1 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Dnah12Q3V0Q1 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dnah12Q3V0Q1 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Dnah12Q3V0Q1 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Dnah12Q3V0Q1 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnah12Q3V0Q1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnah12Q3V0Q1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnah12Q3V0Q1 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnah12Q3V0Q1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Dnah12Q3V0Q1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnah12Q3V0Q1 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Dnah12Q3V0Q1 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnah12Q3V0Q1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnah12Q3V0Q1 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dnah12Q3V0Q1 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnah12Q3V0Q1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnah12Q3V0Q1 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnah12Q3V0Q1 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dnah12Q3V0Q1 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnah12Q3V0Q1 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnah12Q3V0Q1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnah12Q3V0Q1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnah12Q3V0Q1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnah12Q3V0Q1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnah12Q3V0Q1 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnah12Q3V0Q1 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnah12Q3V0Q1 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnah12Q3V0Q1 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnah12Q3V0Q1 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dnah12Q3V0Q1 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnah12Q3V0Q1 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dnah12Q3V0Q1 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dnah12Q3V0Q1 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dnah12Q3V0Q1 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnah12Q3V0Q1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnah12Q3V0Q1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dnah12Q3V0Q1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnah12Q3V0Q1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnah12Q3V0Q1 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnah12Q3V0Q1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dnah12Q3V0Q1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnah12Q3V0Q1 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnah12Q3V0Q1 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Dnah12Q3V0Q1 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Dnah12Q3V0Q1 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dnah12Q3V0Q1 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnah12Q3V0Q1 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnah12Q3V0Q1 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnah12Q3V0Q1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnah12Q3V0Q1 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dnah12Q3V0Q1 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Dnah12Q3V0Q1 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnah12Q3V0Q1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnah12Q3V0Q1 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dnah12Q3V0Q1 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dnah12Q3V0Q1 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Dnah12Q3V0Q1 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Dnah12Q3V0Q1 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnah12Q3V0Q1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnah12Q3V0Q1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnah12Q3V0Q1 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dnah12Q3V0Q1 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dnah12Q3V0Q1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dnah12Q3V0Q1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnah12Q3V0Q1 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnah12Q3V0Q1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dnah12Q3V0Q1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnah12Q3V0Q1 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnah12Q3V0Q1 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Dnah12Q3V0Q1 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms