Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp48Q3V0C5 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
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Usp48Q3V0C5 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp48Q3V0C5 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
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