Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
E330034G19RikQ3UWX6 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E330034G19RikQ3UWX6 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
E330034G19RikQ3UWX6 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E330034G19RikQ3UWX6 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E330034G19RikQ3UWX6 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
E330034G19RikQ3UWX6 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E330034G19RikQ3UWX6 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E330034G19RikQ3UWX6 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E330034G19RikQ3UWX6 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E330034G19RikQ3UWX6 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
E330034G19RikQ3UWX6 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
E330034G19RikQ3UWX6 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E330034G19RikQ3UWX6 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
E330034G19RikQ3UWX6 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
E330034G19RikQ3UWX6 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
E330034G19RikQ3UWX6 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
E330034G19RikQ3UWX6 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
E330034G19RikQ3UWX6 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
E330034G19RikQ3UWX6 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
E330034G19RikQ3UWX6 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
E330034G19RikQ3UWX6 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
E330034G19RikQ3UWX6 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
E330034G19RikQ3UWX6 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.02■□□□□ -0
E330034G19RikQ3UWX6 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
E330034G19RikQ3UWX6 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
E330034G19RikQ3UWX6 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
E330034G19RikQ3UWX6 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
E330034G19RikQ3UWX6 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
E330034G19RikQ3UWX6 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.02■□□□□ -0
E330034G19RikQ3UWX6 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.02■□□□□ -0
E330034G19RikQ3UWX6 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
E330034G19RikQ3UWX6 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.02■□□□□ -0
E330034G19RikQ3UWX6 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
E330034G19RikQ3UWX6 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
E330034G19RikQ3UWX6 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
E330034G19RikQ3UWX6 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
E330034G19RikQ3UWX6 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
E330034G19RikQ3UWX6 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15□□□□□ -0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15□□□□□ -0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
E330034G19RikQ3UWX6 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15□□□□□ -0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15□□□□□ -0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15□□□□□ -0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15□□□□□ -0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms