Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW12

Cnga4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga4Q3UW12 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cnga4Q3UW12 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnga4Q3UW12 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cnga4Q3UW12 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cnga4Q3UW12 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cnga4Q3UW12 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cnga4Q3UW12 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnga4Q3UW12 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnga4Q3UW12 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnga4Q3UW12 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cnga4Q3UW12 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnga4Q3UW12 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cnga4Q3UW12 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnga4Q3UW12 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnga4Q3UW12 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cnga4Q3UW12 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnga4Q3UW12 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnga4Q3UW12 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnga4Q3UW12 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnga4Q3UW12 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnga4Q3UW12 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnga4Q3UW12 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnga4Q3UW12 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cnga4Q3UW12 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnga4Q3UW12 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnga4Q3UW12 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnga4Q3UW12 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cnga4Q3UW12 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnga4Q3UW12 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cnga4Q3UW12 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cnga4Q3UW12 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnga4Q3UW12 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnga4Q3UW12 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnga4Q3UW12 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cnga4Q3UW12 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnga4Q3UW12 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnga4Q3UW12 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnga4Q3UW12 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cnga4Q3UW12 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cnga4Q3UW12 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cnga4Q3UW12 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cnga4Q3UW12 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnga4Q3UW12 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnga4Q3UW12 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnga4Q3UW12 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnga4Q3UW12 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnga4Q3UW12 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cnga4Q3UW12 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnga4Q3UW12 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnga4Q3UW12 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnga4Q3UW12 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnga4Q3UW12 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnga4Q3UW12 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnga4Q3UW12 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnga4Q3UW12 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnga4Q3UW12 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnga4Q3UW12 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnga4Q3UW12 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnga4Q3UW12 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnga4Q3UW12 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms