Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV5

Skap1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap1Q3UUV5 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Csn3-201ENSMUST00000001667 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Tcf21-201ENSMUST00000049930 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Gm12249-201ENSMUST00000132323 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Gm38217-201ENSMUST00000194358 910 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms