Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms