Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Znf48Q3US17 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Znf48Q3US17 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Znf48Q3US17 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Znf48Q3US17 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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