Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms