Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Tmem253Q3UNB8 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Tmem253Q3UNB8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Tmem253Q3UNB8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Tmem253Q3UNB8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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