Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Hdgfl2Q3UMU9 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Hdgfl2Q3UMU9 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Hdgfl2Q3UMU9 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Hdgfl2Q3UMU9 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Hdgfl2Q3UMU9 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Hdgfl2Q3UMU9 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Hdgfl2Q3UMU9 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Hdgfl2Q3UMU9 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hdgfl2Q3UMU9 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Hdgfl2Q3UMU9 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdgfl2Q3UMU9 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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