Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms