Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sf3b2Q3UJB0 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms