Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFB2

Znhit6, Box C/D snoRNA protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znhit6Q3UFB2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znhit6Q3UFB2 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms