Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms