Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
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Cops9Q3U898 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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