Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Q3U6N9 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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Q3U6N9 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
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Q3U6N9 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
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Q3U6N9 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
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Q3U6N9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Q3U6N9 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Q3U6N9 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Q3U6N9 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Q3U6N9 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Q3U6N9 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
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Q3U6N9 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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Q3U6N9 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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Q3U6N9 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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Q3U6N9 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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Q3U6N9 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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Q3U6N9 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
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Q3U6N9 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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