Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3S3

Cenpl, Centromere protein L, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenplQ3U3S3 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CenplQ3U3S3 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CenplQ3U3S3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CenplQ3U3S3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CenplQ3U3S3 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CenplQ3U3S3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CenplQ3U3S3 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CenplQ3U3S3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CenplQ3U3S3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CenplQ3U3S3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CenplQ3U3S3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CenplQ3U3S3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CenplQ3U3S3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CenplQ3U3S3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CenplQ3U3S3 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CenplQ3U3S3 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CenplQ3U3S3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CenplQ3U3S3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CenplQ3U3S3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CenplQ3U3S3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CenplQ3U3S3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CenplQ3U3S3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CenplQ3U3S3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CenplQ3U3S3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CenplQ3U3S3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CenplQ3U3S3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CenplQ3U3S3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CenplQ3U3S3 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CenplQ3U3S3 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CenplQ3U3S3 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CenplQ3U3S3 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CenplQ3U3S3 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CenplQ3U3S3 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CenplQ3U3S3 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CenplQ3U3S3 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CenplQ3U3S3 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CenplQ3U3S3 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CenplQ3U3S3 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CenplQ3U3S3 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CenplQ3U3S3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CenplQ3U3S3 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CenplQ3U3S3 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CenplQ3U3S3 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CenplQ3U3S3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CenplQ3U3S3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CenplQ3U3S3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CenplQ3U3S3 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CenplQ3U3S3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CenplQ3U3S3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CenplQ3U3S3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CenplQ3U3S3 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CenplQ3U3S3 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CenplQ3U3S3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CenplQ3U3S3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CenplQ3U3S3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CenplQ3U3S3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CenplQ3U3S3 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CenplQ3U3S3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CenplQ3U3S3 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CenplQ3U3S3 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CenplQ3U3S3 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CenplQ3U3S3 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CenplQ3U3S3 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CenplQ3U3S3 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CenplQ3U3S3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CenplQ3U3S3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CenplQ3U3S3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CenplQ3U3S3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CenplQ3U3S3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CenplQ3U3S3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CenplQ3U3S3 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CenplQ3U3S3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CenplQ3U3S3 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CenplQ3U3S3 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CenplQ3U3S3 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CenplQ3U3S3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CenplQ3U3S3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CenplQ3U3S3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CenplQ3U3S3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CenplQ3U3S3 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CenplQ3U3S3 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CenplQ3U3S3 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CenplQ3U3S3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CenplQ3U3S3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CenplQ3U3S3 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CenplQ3U3S3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CenplQ3U3S3 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CenplQ3U3S3 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CenplQ3U3S3 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CenplQ3U3S3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CenplQ3U3S3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CenplQ3U3S3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CenplQ3U3S3 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CenplQ3U3S3 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms