Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms