Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc174Q3U155 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms