Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Palb2Q3U0P1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms