Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms