Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3TTJ4 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms