Protein–RNA interactions for Protein: Q3TS39

1700066B19Rik, RIKEN cDNA 1700066B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700066B19RikQ3TS39 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700066B19RikQ3TS39 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700066B19RikQ3TS39 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700066B19RikQ3TS39 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700066B19RikQ3TS39 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700066B19RikQ3TS39 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700066B19RikQ3TS39 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700066B19RikQ3TS39 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700066B19RikQ3TS39 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700066B19RikQ3TS39 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700066B19RikQ3TS39 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700066B19RikQ3TS39 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700066B19RikQ3TS39 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700066B19RikQ3TS39 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
1700066B19RikQ3TS39 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700066B19RikQ3TS39 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700066B19RikQ3TS39 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700066B19RikQ3TS39 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700066B19RikQ3TS39 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700066B19RikQ3TS39 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
1700066B19RikQ3TS39 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700066B19RikQ3TS39 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700066B19RikQ3TS39 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700066B19RikQ3TS39 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700066B19RikQ3TS39 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700066B19RikQ3TS39 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700066B19RikQ3TS39 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700066B19RikQ3TS39 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700066B19RikQ3TS39 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700066B19RikQ3TS39 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700066B19RikQ3TS39 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700066B19RikQ3TS39 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700066B19RikQ3TS39 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700066B19RikQ3TS39 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700066B19RikQ3TS39 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700066B19RikQ3TS39 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700066B19RikQ3TS39 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700066B19RikQ3TS39 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700066B19RikQ3TS39 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700066B19RikQ3TS39 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700066B19RikQ3TS39 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700066B19RikQ3TS39 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700066B19RikQ3TS39 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700066B19RikQ3TS39 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700066B19RikQ3TS39 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
1700066B19RikQ3TS39 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
1700066B19RikQ3TS39 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700066B19RikQ3TS39 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700066B19RikQ3TS39 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700066B19RikQ3TS39 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
1700066B19RikQ3TS39 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700066B19RikQ3TS39 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700066B19RikQ3TS39 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
1700066B19RikQ3TS39 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700066B19RikQ3TS39 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
1700066B19RikQ3TS39 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
1700066B19RikQ3TS39 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
1700066B19RikQ3TS39 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
1700066B19RikQ3TS39 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
1700066B19RikQ3TS39 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
1700066B19RikQ3TS39 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
1700066B19RikQ3TS39 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
1700066B19RikQ3TS39 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
1700066B19RikQ3TS39 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
1700066B19RikQ3TS39 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
1700066B19RikQ3TS39 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
1700066B19RikQ3TS39 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
1700066B19RikQ3TS39 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
1700066B19RikQ3TS39 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
1700066B19RikQ3TS39 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
1700066B19RikQ3TS39 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
1700066B19RikQ3TS39 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
1700066B19RikQ3TS39 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
1700066B19RikQ3TS39 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
1700066B19RikQ3TS39 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
1700066B19RikQ3TS39 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
1700066B19RikQ3TS39 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
1700066B19RikQ3TS39 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
1700066B19RikQ3TS39 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
1700066B19RikQ3TS39 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
1700066B19RikQ3TS39 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
1700066B19RikQ3TS39 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
1700066B19RikQ3TS39 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
1700066B19RikQ3TS39 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
1700066B19RikQ3TS39 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
1700066B19RikQ3TS39 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
1700066B19RikQ3TS39 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
1700066B19RikQ3TS39 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
1700066B19RikQ3TS39 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
1700066B19RikQ3TS39 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
1700066B19RikQ3TS39 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
1700066B19RikQ3TS39 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
1700066B19RikQ3TS39 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
1700066B19RikQ3TS39 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
1700066B19RikQ3TS39 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
1700066B19RikQ3TS39 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
1700066B19RikQ3TS39 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
1700066B19RikQ3TS39 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
1700066B19RikQ3TS39 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
1700066B19RikQ3TS39 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms