Protein–RNA interactions for Protein: Q3TNA1

Xylb, Xylulose kinase, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XylbQ3TNA1 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
XylbQ3TNA1 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
XylbQ3TNA1 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
XylbQ3TNA1 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
XylbQ3TNA1 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
XylbQ3TNA1 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
XylbQ3TNA1 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
XylbQ3TNA1 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
XylbQ3TNA1 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
XylbQ3TNA1 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
XylbQ3TNA1 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
XylbQ3TNA1 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
XylbQ3TNA1 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
XylbQ3TNA1 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
XylbQ3TNA1 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
XylbQ3TNA1 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
XylbQ3TNA1 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
XylbQ3TNA1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
XylbQ3TNA1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
XylbQ3TNA1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
XylbQ3TNA1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
XylbQ3TNA1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
XylbQ3TNA1 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
XylbQ3TNA1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
XylbQ3TNA1 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
XylbQ3TNA1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
XylbQ3TNA1 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
XylbQ3TNA1 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
XylbQ3TNA1 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
XylbQ3TNA1 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
XylbQ3TNA1 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
XylbQ3TNA1 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
XylbQ3TNA1 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
XylbQ3TNA1 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
XylbQ3TNA1 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
XylbQ3TNA1 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
XylbQ3TNA1 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
XylbQ3TNA1 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
XylbQ3TNA1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
XylbQ3TNA1 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
XylbQ3TNA1 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
XylbQ3TNA1 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
XylbQ3TNA1 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
XylbQ3TNA1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
XylbQ3TNA1 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
XylbQ3TNA1 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
XylbQ3TNA1 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
XylbQ3TNA1 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
XylbQ3TNA1 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
XylbQ3TNA1 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
XylbQ3TNA1 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
XylbQ3TNA1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
XylbQ3TNA1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
XylbQ3TNA1 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
XylbQ3TNA1 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
XylbQ3TNA1 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
XylbQ3TNA1 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
XylbQ3TNA1 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
XylbQ3TNA1 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
XylbQ3TNA1 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
XylbQ3TNA1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
XylbQ3TNA1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
XylbQ3TNA1 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
XylbQ3TNA1 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
XylbQ3TNA1 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
XylbQ3TNA1 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
XylbQ3TNA1 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
XylbQ3TNA1 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
XylbQ3TNA1 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
XylbQ3TNA1 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
XylbQ3TNA1 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
XylbQ3TNA1 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
XylbQ3TNA1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
XylbQ3TNA1 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms