Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc102aQ3TMW1 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms