Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc10Q3TLI0 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms