Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.1 ms