Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGF2

Fam107b, Protein FAM107B, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam107bQ3TGF2 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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