Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Prr27Q3SYJ2 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Prr27Q3SYJ2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Prr27Q3SYJ2 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Prr27Q3SYJ2 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms