Protein–RNA interactions for Protein: Q307W7

Kncn, Kinocilin, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KncnQ307W7 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
KncnQ307W7 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
KncnQ307W7 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
KncnQ307W7 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
KncnQ307W7 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
KncnQ307W7 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
KncnQ307W7 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
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KncnQ307W7 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
KncnQ307W7 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
KncnQ307W7 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
KncnQ307W7 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
KncnQ307W7 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
KncnQ307W7 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
KncnQ307W7 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
KncnQ307W7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
KncnQ307W7 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
KncnQ307W7 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
KncnQ307W7 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
KncnQ307W7 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
KncnQ307W7 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
KncnQ307W7 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
KncnQ307W7 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
KncnQ307W7 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
KncnQ307W7 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
KncnQ307W7 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
KncnQ307W7 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
KncnQ307W7 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
KncnQ307W7 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
KncnQ307W7 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
KncnQ307W7 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
KncnQ307W7 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
KncnQ307W7 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
KncnQ307W7 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
KncnQ307W7 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
KncnQ307W7 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
KncnQ307W7 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
KncnQ307W7 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
KncnQ307W7 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
KncnQ307W7 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
KncnQ307W7 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
KncnQ307W7 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
KncnQ307W7 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
KncnQ307W7 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
KncnQ307W7 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
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KncnQ307W7 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
KncnQ307W7 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
KncnQ307W7 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
KncnQ307W7 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
KncnQ307W7 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
KncnQ307W7 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
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KncnQ307W7 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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KncnQ307W7 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
KncnQ307W7 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
KncnQ307W7 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
KncnQ307W7 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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KncnQ307W7 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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KncnQ307W7 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
KncnQ307W7 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
KncnQ307W7 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
KncnQ307W7 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
KncnQ307W7 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
KncnQ307W7 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
KncnQ307W7 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
KncnQ307W7 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
KncnQ307W7 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
KncnQ307W7 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
KncnQ307W7 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
KncnQ307W7 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
KncnQ307W7 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
KncnQ307W7 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC12□□□□□ -0.49
KncnQ307W7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
KncnQ307W7 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
KncnQ307W7 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
KncnQ307W7 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
KncnQ307W7 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
KncnQ307W7 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
KncnQ307W7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC12□□□□□ -0.49
KncnQ307W7 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
KncnQ307W7 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
KncnQ307W7 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
KncnQ307W7 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
KncnQ307W7 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
KncnQ307W7 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
KncnQ307W7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
KncnQ307W7 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
KncnQ307W7 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC12□□□□□ -0.49
KncnQ307W7 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms