Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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