Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms