Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rundc1Q0VDN7 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rundc1Q0VDN7 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.3 ms