Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBL1

Tigd2, Tigger transposable element-derived protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tigd2Q0VBL1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tigd2Q0VBL1 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms