Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Itgb8Q0VBD0 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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