Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms