Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnma1Q08460 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms