Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Cnn1Q08091 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms