Protein–RNA interactions for Protein: Q08024

Cbfb, Core-binding factor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CbfbQ08024 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CbfbQ08024 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms