Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
NrepQ07475 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NrepQ07475 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
NrepQ07475 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NrepQ07475 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NrepQ07475 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
NrepQ07475 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NrepQ07475 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NrepQ07475 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NrepQ07475 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms