Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms