Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Gm5133-201ENSMUST00000118940 1255 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Gm20821-201ENSMUST00000179829 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 CT010480.1-201ENSMUST00000223612 363 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Prl7a1-203ENSMUST00000224852 1283 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Prl7a1-201ENSMUST00000006659 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 4930532G15Rik-202ENSMUST00000195314 1457 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Gm45175-201ENSMUST00000208295 1375 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Gm14301-201ENSMUST00000120181 324 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Gm42565-201ENSMUST00000197839 572 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Gm44683-201ENSMUST00000209088 484 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 AC153512.2-201ENSMUST00000220363 1273 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Gm25131-201ENSMUST00000082653 151 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Gm25653-201ENSMUST00000158473 138 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.4 ms