Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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Sh3bp2Q06649 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Sh3bp2Q06649 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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Sh3bp2Q06649 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Sh3bp2Q06649 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Sh3bp2Q06649 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Sh3bp2Q06649 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Sh3bp2Q06649 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Sh3bp2Q06649 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Sh3bp2Q06649 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Sh3bp2Q06649 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Sh3bp2Q06649 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp2Q06649 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms