Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Prrx2Q06348 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Prrx2Q06348 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrx2Q06348 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrx2Q06348 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrx2Q06348 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrx2Q06348 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrx2Q06348 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrx2Q06348 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrx2Q06348 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrx2Q06348 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrx2Q06348 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrx2Q06348 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrx2Q06348 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrx2Q06348 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrx2Q06348 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrx2Q06348 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrx2Q06348 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrx2Q06348 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrx2Q06348 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrx2Q06348 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrx2Q06348 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrx2Q06348 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrx2Q06348 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrx2Q06348 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrx2Q06348 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrx2Q06348 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrx2Q06348 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrx2Q06348 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrx2Q06348 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrx2Q06348 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrx2Q06348 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrx2Q06348 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrx2Q06348 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrx2Q06348 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrx2Q06348 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrx2Q06348 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrx2Q06348 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Prrx2Q06348 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prrx2Q06348 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prrx2Q06348 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prrx2Q06348 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms