Protein–RNA interactions for Protein: Q06335

Aplp2, Amyloid-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aplp2Q06335 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Aplp2Q06335 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms